Секвенирование одноклеточной РНК антигенпрезентирующих клеток крови при тяжелой форме COVID-19 выявляет многопроцессорные дефекты противовирусного иммунитета

23.05.2021

Источник: Nat Cell Biol

Аннотация

COVID-19 может привести к опасной для жизни дыхательной недостаточности с повышением медиаторов воспаления и вирусной нагрузки. В данном исследовании мы выполняли секвенирование одноклеточной РНК для создания карты высокого разрешения антиген-представляющих клеток крови (APC) у 15 пациентов с умеренной или тяжелой пневмонией COVID-19 на 1-й и 4-й день после поступления в отделение интенсивной терапии. или отделения пульмонологии, а также у 4 здоровых доноров. Мы создали уникальный набор данных из 81 643 APC, включая моноциты и редкие подмножества дендритных клеток (DC). Мы обнаружили многопроцессорные дефекты противовирусной иммунной защиты в конкретных APC у пациентов с тяжелым заболеванием: (1) усиление проапоптотических путей в плазмоцитоидных DC (pDC, ключевые эффекторы противовирусного иммунитета), (2) снижение врожденных сенсоров TLR9 и DHX36 в pDC и CLEC9a + DC, соответственно, (3) подавление антивирусных генов, стимулированных интерфероном, в субпопуляциях моноцитов и (4) снижение генов, связанных с главным комплексом гистосовместимости (MHC) класса II, и трансактиваторной активности MHC класса II в cDC1c + DCs , что свидетельствует о вирусном подавлении презентации антигена. Эти новые механизмы могут объяснить ухудшение состояния пациента и предложить стратегии восстановления дефектной иммунной защиты.

Ключевые слова:
COVID-19, кроветворение, презентация антигена, противовирусный иммунитет, MHC класса II

Ссылка: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33972731/

DOI: 10.1038/s41556-021-00681-2.